生物化学与生物医药化学
基因编辑(CRISPR)
CRISPR–Cas系统将向导依赖的核酸识别转化为可编程的基因组靶向工具。
直觉直觉:核心思想
CRISPR–Cas系统将向导依赖的核酸识别转化为可编程的基因组靶向工具。
中学阶段基础:核心概念与初步应用
定义: 核心概念
SpCas9借助向导RNA结合PAM邻近靶位点并造成双链断裂。NHEJ可产生插入缺失;HDR可利用供体模板。
源自细菌适应性免疫的CRISPR系统将向导RNA与Cas9等核酸酶配对。DNA双链断裂经细胞修复:末端连接易致基因失活,同源修复可写入编辑。
| 术语 | 解释 |
|---|---|
| 向导RNA | 引导Cas蛋白至互补靶标的短RNA。 |
| PAM | 许多Cas核酸酶要求靶点旁的短DNA基序。 |
| HDR | 利用供体模板的同源修复。 |
例题: 应用概念
为何相同CRISPR核酸酶在不同细胞中会产生不同序列结果?
解答
核酸酶造成损伤,但修复途径、细胞周期、供体可用性和局部序列背景决定最终等位基因。
大学大学阶段:定量描述
编辑结果不只取决于切割:向导结合动力学、PAM可用性、染色质可及性及修复途径偏倚都重要。
进阶进阶:假设与机制细节
除SpCas9外,Cas12a、碱基编辑器、先导编辑器与表观基因组编辑器在PAM范围、切口/双链断裂、精度和递送约束上各有权衡。
科研研究前沿:开放问题与当前实践
参考文献
- A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity · Martin Jinek; Krzysztof Chylinski; Ines Fonfara; Michael Hauer; Jennifer A. Doudna; Emmanuelle Charpentier, 2012
- The new frontier of genome engineering with CRISPR-Cas9 · Jennifer A. Doudna; Emmanuelle Charpentier, 2014