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生化学・生物医化学

構造活性相関(SAR)

構造活性相関(SAR)は類縁分子を比較し、化学構造の変化が測定された生物応答へ及ぼす影響を調べる。

直観直観:中心となる考え

構造活性相関(SAR)は類縁分子を比較し、化学構造の変化が測定された生物応答へ及ぼす影響を調べる。

模式図を操作しよう。概念を示すもので、実験的証拠の代用ではない。

学校基礎:重要概念と初歩的な応用

定義: 基本概念

対応分子対、置換基定数、定量モデルで傾向を探れるが、アッセイ条件、溶解性、曝露量を統制する必要がある。

関連化合物が決まった部位で異なるときSARが見える。疎水性・立体・電子的記述子は結合、膜透過、代謝に関係する性質を捉える。

用語と意味
用語解釈
pIC₅₀半最大阻害濃度の負対数。
logPオクタノール–水分配係数の対数。
置換基定数置換基効果を比較するσやπなどの記述子。

例: 考えてみよう

化合物のIC50=1IC_{50}=1 μMである。pIC₅₀はいくつか。

解答

11 μMは10−610^{-6} Mなので−log⁡10(10−6)=6-\log_{10}(10^{-6})=6。これはアッセイ依存の効力指標であり、必ずしも結合親和性ではない。

大学大学:定量的な記述

pIC50=−log⁡10(IC50[M])\mathrm{pIC}_{50}=-\log_{10}(IC_{50}[\mathrm{M}])

ハンシュ解析は電子的・疎水的・立体的寄与を分ける。係数は作った類縁体集合とアッセイを反映するため注意深く解釈する。

参考文献